Морфеус – капитан корабля «Навуходоносор». Он служил в оборонных силах города от нападения со стороны машин. Морфеус является воспитанным человеком, что вызывает уважение многих, кто столкнулся с ним. В результате его веры в пророчество избранного, он посвятил всю свою жизнь в поисках того, кто мог спасти Зион и людей от уничтожения, положив конец войне машин.