Из основных отличий версии игры «Школы мастерства» от классического «Зельеварения» можно выделить следующие:

• Появились жетоны магем, своеобразный джокер. Одна магема может заменить любой ингредиент, две магемы заменяют зелье, а три – элексир.
• Шкаф с самого начала партии наполнен ингредиентами и имеет вид планшета.
• Счетчик очков заменили жетоны и кристаллы разной ценности, что несколько затрудняет подсчет очков конкурентов во время партии.